Когда составлено расписание для каждой группы, можно выставлять посещаемость. Для каждого ребенка ставятся только пропуски. По умолчанию пропуски может выставлять только воспитатель(классный руководитель) для своей группы(класса). 

Для того, чтобы вы могли выставить пропуски всем группам, находяь под пользователем с ролью "Администратор", вам нужно назначить соответствующие права.

Меню Упрасление-Права доступа, отмечаем пункт "Редактировать оценки и посещаемость для всех групп" и сохраняем изменения.

Теперь, в меню Журнал-Посещаемость, вы можете выбрать ребенка, нажав на его фамилию, и выставить пропуски.